Provalidatoruna herramienta para diseño y validación de profiles

  1. Molina Henares, Antonio Jesús
Supervised by:
  1. Juan Luis Ramos Director

Defence university: Universidad de Granada

Fecha de defensa: 25 June 2010

Committee:
  1. Armando Blanco Morón Chair
  2. Fernando José Martínez-Checa Barrero Secretary
  3. Cristina Rubio Escudero Committee member
  4. Estrella Duque Martín de Oliva Committee member
  5. María Trinidad Gallegos Fernández Committee member

Type: Thesis

Teseo: 292641 DIALNET lock_openDIGIBUG editor

Abstract

Provalidator es una herramienta concebida para automatizar todo lo posible la tarea de crear un profile para definir familias de proteínas. En esta tesis se ha integrado los algoritmos de inteligencia artificial en el proceso de elección tanto del conjunto de secuencias que formarán la semilla del profile como de la región del alineamiento múltiple elegida para construirlo. Por último, permite la validación del profile construido usando la base de datos InterPro para comparar los resultados con los obtenidos por otros métodos de clasificación.