Changes through time in genomic diversity of gray wolf (canis lupus) populations

Resumen

Los factores humanos, incluyendo la fragmentación del hábitat y la persecución directa, han causado el declive de las poblaciones de grandes depredadores durante los últimos dos siglos. Los declives demográficos reducen la diversidad genética en las poblaciones silvestres, especialmente en aquellas pequeñas y aisladas. En esta tesis, investigo cómo los declives poblaciones del pasado han impactado la diversidad genética de un gran depredador con una amplia distribución, el lobo gris (Canis lupus). Concretamente, me centro en dos poblaciones de lobos que se encuentran al sur y aisladas, con diferente tamaño poblacional y escenario demográfico: una muy pequeña y reintroducida tras su extinción en estado silvestre, el lobo mexicano (C. l. baileyi), y otra relativamente grande y estable tras su recuperación parcial de un cuello de botella poblacional, el lobo ibérico (C. l. signatus). Dado que la combinación de muestras no invasivas y microsatélites como marcadores genéticos ha sido comúnmente utilizado para medir la variación genética en las poblaciones de lobos, primero evalúo la capacidad de varios programas para proporcionar genotipos consistentes para microsatélites a partir del análisis de excrementos de lobos y utilizando métodos de secuenciación masiva. A continuación, utilizando datos derivados de la secuenciación de genomas completo y especímenes de museo, evalúo el cambio en diversidad genética y endogamia a través del tiempo en las poblaciones de lobos mexicanos e ibéricos. Mis resultados revelan una pérdida de diversidad genética en ambas poblaciones, y sugieren una fragmentación a pequeña escala en la población ibérica contemporánea. Mis hallazgos remarcan la importancia del monitoreo genético de las poblaciones silvestres, incluso aquellas con tamaños poblacionales aparentemente grandes o estables. Preservar la diversidad genética en poblaciones de grandes depredadores es crucial para asegurar su viabilidad a largo plazo y su papel fundamental en los ecosistemas.